Co je třeba vědět
- Soubor FNA je soubor DNA a sekvence proteinové sekvence ve formátu FASTA.
- Otevřete jeden s Geneiousem.
- Převeďte na FASTA a podobné formáty pomocí stejného programu.
Tento článek vysvětluje, co jsou soubory FNA, jak je otevřít a jak uložit jeden do jiného formátu, jako je FASTA, GB, VCF, obrázky atd.
Co je soubor FNA?
Soubor s příponou FNA je soubor FASTA Format DNA and Protein Sequence Alignment, který ukládá informace o DNA, které lze použít v softwaru pro molekulární biologii. Soubory FNA, konkrétně, mohou být použity k uchovávání pouze informací o nukleových kyselinách, zatímco jiné formáty FASTA obsahují další informace související s DNA, jako jsou ty s FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET nebo AA přípony souborů. Tyto textové formáty FASTA původně vznikly ze softwarového balíčku se stejným názvem, ale nyní se používají jako standard v aplikacích pro zarovnání sekvencí DNA a proteinů.
Jak otevřít soubor FNA
Soubory FNA lze otevřít v operačních systémech Windows, Mac a Linux pomocí Geneious (je zdarma po dobu 14 dnů). Chcete-li to provést, přejděte na Soubor > Import v nabídce a zvolte import souboru FNA pomocí Ze souboru položka nabídky. Také byste mohli být schopni otevřít soubory FNA pomocí nástroje BLAST Ring Image Generator (BRIG). Pokud výše uvedené nápady nefungují, zkuste jej otevřít pomocí programu Poznámkový blok ++ nebo jiného textového editoru. Soubor může být skutečně textový a snadno čitelný, nebo zjistíte, že nemá nic společného s formátem FASTA. V takovém případě může otevření souboru jako textového dokumentu odhalit text, který identifikuje, co bylo použito k vytvoření souboru. nebo v jakém formátu je soubor. Pokud zjistíte, že se aplikace ve vašem počítači pokusí otevřít soubor FNA, ale je to nesprávná aplikace, nebo pokud byste raději měli jiný nainstalovaný program otevírat soubory FNA, můžete změnit výchozí program pro konkrétní přípona souboru ve Windows.
Jak převést soubor FNA
Nemůžeme to ověřit, protože jsme to nezkoušeli, ale měli byste být schopni použít Geneious k převodu souboru FNA do mnoha dalších formátů, jako jsou FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV a VCF. To lze provést prostřednictvím programu Soubor > Vývozní Jídelní lístek. Geneious by měl být také schopen převést soubor na obrázek ve formátu PNG, JPG, EPS nebo PDF prostřednictvím Soubor > Uložit jako obrazový soubor. Ačkoli normálně nemůžete pouze přejmenovat příponu souboru na něco jiného a očekávat, že bude fungovat stejným způsobem, vy umět přejmenujte soubor .FNA na soubor .FA, pokud váš konkrétní software pro sekvenování DNA rozpozná pouze formát FA. Místo přejmenování přípon souborů budete chtít k převodu dalších typů souborů použít bezplatný převaděč souborů. V případě souborů FNA a FA se stane, že některé programy otevřou pouze soubory, které mají příponu FA, v takovém případě by přejmenování mělo fungovat dobře.
Stále to nemůžete otevřít?
Pokud po použití výše uvedených programů stále nemůžete otevřít soubor, možná zjistíte, že přípona souboru ve skutečnosti nečte .FNA, ale místo toho něco, co jen vzhled podobný. Například soubory FNG (Font Navigator Group) vypadají strašně moc, jako by říkaly „.FNA“, ale pokud se podíváte pozorně, jsou jen první dvě písmena stejná. Protože se přípony souborů liší, znamená to, že mají jiný formát souboru a pravděpodobně nebudou fungovat se stejnými programy. Totéž lze říci o mnoha dalších příponách souborů, jako jsou FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) a FND (Windows Saved Search). Myšlenkou je pouze zajistit, aby přípona souboru četla .FNA. Pokud ano, zkuste jej znovu otevřít nebo převést pomocí výše uvedených programů. Pokud máte jiný druh souboru, prozkoumejte příponu souboru a zjistěte, které aplikace jsou potřebné k jeho otevření nebo převodu. FAQ
-
Jak otevřete soubor FNA v Pythonu?
Nejprve převeďte soubor FNA do formátu FASTA pomocí aplikace třetí strany, jako je Geneious. Poté si můžete stáhnout Biopython, sadu volně dostupných nástrojů pro biologické výpočty pro práci v bioinformatice. Nakonec najdete pokyny v práci se soubory FASTA v Biopython Tutorial a Cookbook.
-
Jak najdu čísla svého výrobce FNA v souboru Ancestry raw?
Většinu údajů o DNA si můžete stáhnout z webu Ancestry.com ve formátu .txt. Možnost stáhnout soubor VCF však mají pouze zákazníci, jejichž DNA byla analyzována pomocí sekvenování nové generace (NGS). Chcete-li stáhnout soubor VCF, musíte být vlastníkem DNA, nechat DNA otestovat pomocí technologie NGS a mít ve svém zařízení k dispozici alespoň 350 MB místa.